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高通量 3D 表型分析是一個迅速崛起的領(lǐng)域，在植物個體測量中有著廣泛的應(yīng)用。盡管如此，由于資金和后勤的限制，高通量植物表型分析很少用于生態(tài)學(xué)研究。


EasyDCP的整體工作流程。(a)必須對每組植物進行成像，并且必須為EasyDCP準(zhǔn)備圖像和配置文件。(b) EasyDCP_Creation對所有圖像集執(zhí)行順序處理，為每組植物創(chuàng)建一個3D點云。(c) EasyDCP_Analysis對每個三維點云進行分類、分割和計算，以測量植物性狀，包括株高和投影葉面積。

作者介紹了EasyDCP，這是一種使用數(shù)碼相機從集裝箱植物圖像中提取3D植物表型特征的軟件工具，已經(jīng)證明了EasyDCP是一種可行的低成本工具，可用于對植物種群進行表型分析，測量性狀的精度與商用激光掃描儀相當(dāng)或略高。計算機硬件和商用三維重建軟件是財務(wù)成本，但與其他三維植物測量工具和高通量表型分析解決方案相比，總成本是可以承受的。與其他基于3d的方法相比，EasyDCP具有更易于使用和更少手動步驟的優(yōu)點，能夠以最少的訓(xùn)練實現(xiàn)高通量操作。


(a)使用EasyDCP和PlantEye激光掃描儀測量的標(biāo)尺長度和實際長度之間的差異。(b)相對于地面真實情況，計算y軸上繪制的植物高度和投影葉面積。黑線代表與地面真實情況的1比1測量

作者比較了EasyDCP與商用激光掃描儀在獲取株高和投影葉面積方面的性能。這兩種工具都與地面真實測量有很強的相關(guān)性，使用EasyDCP進行的株高測量更準(zhǔn)確（株高：EasyDCP r2=0.96，激光r2=0.86；投影葉面積：EasyDCP r2=0.96，激光r2=0.96。EasyDCP是一種高通量、低勞動力和經(jīng)濟成本的容器植物表型性狀測量開源軟件工具。

來源：Wiley Online Library.EasyDCP: An affordable, high-throughput tool to measure plant phenotypic traits in 3D
Alexander Feldman, Haozhou Wang, Yuya Fukano, Yoichiro Kato, Seishi Ninomiya, Wei Guo
https://besjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/2041-210X.13645